土壤养分是土壤肥力因素之一，是农作物的营养物质基础。济南市土壤耕作培肥历史悠久，养分含量较高，但不同的土壤类型养分含量很不平衡。以城市附近最高，距城市远的地方含量低，但总的状况是有机质含量不高，普遍缺氮，严重缺磷，部分缺钾、缺锌。
　　一、土壤有机质　全市土壤有机质平均含量1.05%。居全国四级中等水平，最高为5.96%，最低为0.52%。其中郊区最高，平均有机质含量为1.32%；长清县最低，平均含量为0.69%。
　　二、土壤全氮及碱解氮　土壤中的全氮含量，表示氮素的供应容量，是土壤中无机态氮和有机态氮的总和，它与有机质含量及氮肥施用量呈正相关。全市全氮含量平均为0.073%，属全国五级，最低含量为0.026%，最高含量为0.234%，相差9倍。其中郊区含量最高，为0.091%；长清含量最低为0.059%。碱解氮是土壤中能被当季作物吸收利用的氮素，能反映近期氮素供应状况。各地块中碱解氮差异较大，最低仅有7ppmppm为百万分之一。，最高达101ppm，全市平均含量为56ppm，属全国五级，普遍缺氮是济南市农业生产中值得引起重视的问题。
　　三、土壤速效磷　土壤速效磷主要指水溶性与弱溶性磷酸盐。磷易被土壤中的钙固定成为难溶性磷，而济南市土壤多为石灰性土壤，速效磷含量较低，全市平均为5ppm，属全国五级。最低为1ppm，最高为54ppm。其中郊区含量最高，为8ppm，章丘为5ppm，历城、平阴、长清均为4ppm。严重缺磷是济南市农业生产中需要解决的一个重要问题。
　　四、土壤速效钾　济南大部分土壤中速效钾含量比较丰富，全市速效钾平均含量96ppm。其中潮土、菜园土最高，在120ppm以上；山岭薄地土壤含量较低，在70ppm左右。部分土壤的速效钾含量已降至50ppm以下，开始出现缺钾症状。